预测蛋白质间相互作用的生物信息学方法

摘要

后基因组时代的研究模式,已从原来的序列-结构-功能转向基因表达-系统动力学-生理功能.建立蛋白质间相互作用的完全网络,即蛋白质相互作用组(interactome),将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并为新药靶点的发现和药物设计提供理论基础.一系列系统分析蛋白质相互作用的实验方法已经建立,近年来,出现了多种预测蛋白质相互作用的生物信息学方法,这些方法不仅是对传统实验方法的有价值的补充,而且能够扩展实验方法的预测范围;同时,在开发这些方法的过程中建立了一些重要的分子进化和分子生物学概念.本文综述了9种生物信息学方法的原理、方法评估、存在的问题,并分析了这个领域的发展前景.