治疗前血浆和全血干血斑样品HIV-1 Pol区基因型耐药检测结果比较

摘要

目的 比较治疗前静脉血浆和全血干血斑(DBS)人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)Pol区基因型耐药检测结果的差异,并分析DBS样品用于HIV-1基因型耐药检测的可行性.方法 采集44例HIV-1感染者治疗前静脉全血,分别制备全血DBS样品和血浆样品,提取RNA,检测病毒载量.采用逆转录PCR(RT-PCR)扩增Pol区基因序列,对PCR产物进行Sanger测序,采用Sequencher 5.4.5软件对序列进行清理和拼接,采用BioEdit 7.2软件对参考株序列和样品序列进行比对、系统进化树分析及基因型耐药分析.结果 治疗前44例血浆样品检出率100.0％,DBS样品检出30例,检出率为68.2％;24例血浆样品平均病毒载量达到5.02×105 IU/mL,中位数为1.76×105 IU/mL,DBS样品平均病毒载量为1.46×103 IU/mL,中位数为7.95×102 IU/mL;44例患者HIV-1亚型主要为流行重组株(CRF)07-BC(24/44)、CRF01-AE(16/44);血浆和DBS样品序列相似值100％26例(26/30),相似值99％3例(3/30),相似值97％1例(1/30),其中有6例发生不同程度的耐药突变,DBS样品耐药结果与血浆符合率100％,但在其他位点的突变存在差异.结论 治疗前全血DBS样品耐药结果及序列与血浆样品具有高度的一致性,全血DBS样品可用于耐药性检测、HIV-1亚型分析,但检出率比血浆低.