基于简单重复序列间扩增分子标记的金钗石斛遗传多样性研究

摘要

[目的]对不同产地金钗石斛进行遗传多样性分析,为金钗石斛的种质资源保护及新品种选育提供参考.[方法]利用简单重复序列间扩增(inter simple sequence repeat,ISSR)分子标记技术对金钗石斛7个地区21个居群的152个样本进行分析,利用POPGENE1.32软件进行遗传多样性指数分析,用NTSYSpc 2.10e软件构建居群间非加权配对算术平均法(unweighted pair group with arithmetic average,UPGMA)聚类图.[结果]筛选出不同产地金钗石斛10条ISSR引物,共扩增出多态性条带292条,多态性百分率为100％.在物种水平,等位基因数是2.0000,有效等位基因数是1.3863,期望杂合度是0.2398,香农信息指数为0.3783;在居群水平,多态百分率为9.93％～47.95％,期望杂合度为0.0411～0.1674,香农信息指数为0.0601～0.2519.遗传结构分析表明,21个居群遗传一致性为0.7149～0.9527,平均为0.8506,居群间的遗传变异(57.79％)略高于居群内(42.21％).在物种水平上,金钗石斛较小的基因流(0.1826)导致了居群的分化.遗传距离聚类分析表明,金钗石斛的遗传距离与地理分布有一定的相关性.[结论]金钗石斛具有丰富的遗传多样性,栽培居群与野生居群的遗传多样性均较高,表明金钗石斛在栽培过程中遗传多样性基本上没有丧失,居群间的遗传变异略高于居群内,说明金钗石斛居群在地区间有遗传分化的趋势.云南居群具有较高的遗传多样性,建议在该地区进行大面积的人工栽培,以栽培品替代野生品作药用,缓解资源紧缺的状况.