基于失巢凋亡基因构建直肠癌预后预测模型

摘要

目的分析失巢凋亡相关基因对直肠癌患者预后的影响。方法从TCGA数据库获得直肠癌患者的基因表达数据,通过最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)构建直肠癌-失巢凋亡基因预后预测模型。使用Kaplan-Meier生存曲线,受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线,单因素和多因素分析等方法对预后预测模型进行评估。通过蛋白相互作用网络筛选与预后模型相关的基因,并进行富集分析。结果6个失巢凋亡基因:酪蛋白激酶2 Alpha 1(casein kinase 2-α1,CSNK2A1)、抑制素Bβ亚基(inhibin subunit beta B,INHBB)、p21活化激酶1(p21-activated kinase 1,PAK1)、CD63分子(CD63 molecule,CD63)、细胞间黏附分子β-1(catenin beta-1,CTNNB1)、促凝集素蛋白(clusterin,CLU)被确定为直肠癌预后相关基因。生存分析结果显示,低风险组预后较高风险组好,且差异有统计学意义(P<0.05),ROC曲线显示预后模型曲线下面积(area under the curve,AUC)在1年内为0.84,在3年内为0.86,在5年内为0.92。富集分析提示预后模型相关基因功能与肿瘤免疫相关。结论通过多种生物信息学方法,构建了基于6个失巢凋亡相关基因的直肠癌预后预测模型,预后模型的风险评分可以作为影响直肠癌预后的独立因素,可能为直肠癌患者的个体化治疗和评估提供参考。