定量比较蛋白质构象的方法

摘要

提出一种定量比较评估一组蛋白质构象的新方法:直接引入三个欧拉角α、β、γ来构造旋转变换矩阵,用共轭梯度法最优化使两个构象对应原子的均方根距离RMSD达到最小来求这三个最佳的欧拉角,从而求得两个迭合得最好的构象之间的RMSD,与Mclachlan提出的方法比较表明这两种方法是等效的。