温州市耐多药/利福平耐药结核分枝杆菌耐药基因突变及特征分析

摘要

目的:通过全基因组测序(WGS)分析温州市耐多药/利福平耐药结核分枝杆菌(MDR/RR-MTB)的耐药情况,为耐药结核病的防治提供参考依据。方法:收集2021年1月至2022年9月温州市中心医院收治的54例MDR/RR-TB患者的菌株与临床资料,对菌株进行WGS。分析菌株对15种抗结核药物的耐药情况,同时绘制耐药情况弦图,以及准广泛耐药结核(Pre-XDR-TB)与广泛耐药结核(XDR-TB)菌株耐药情况热图。结果:54例患者中,男性占75.93%,>45岁占50.00%,温州本地户籍占83.33%,无固定职业占92.59%,治疗类型中复治占40.74%。患者性别(男、女)间,年龄(45岁)间,户籍(本地、外地)间,职业(无固定职业及体力劳动者、非体力劳动者)间比较差异有统计学意义(P0.05)。54株菌株对药物的耐药率从高到低依次为利福平(100.00%,54/54)、异烟肼(83.33%,45/54)、链霉素(50.00%,27/54)、乙胺丁醇(38.89%,21/54)、吡嗪酰胺(35.19%,19/54)、氟喹诺酮类(24.07%,13/54)、丙硫异烟胺(24.07%,13/54)、卡那霉素(9.26%,5/54)、阿米卡星(9.26%,5/54)、卷曲霉素(9.26%,5/54)、对氨基水杨酸(7.41%,4/54)、利奈唑胺(1.85%,1/54);对贝达喹啉、环丝氨酸、氯法齐明未产生耐药。共检出65种基因突变类型,以kat G_S315T(35株,占77.78%)、rpo B_S450L(26株,占48.15%)、embB_M306V(11株,占52.38%)、rps L_K43R(21株,占77.78%)、gyr A_D94G(4株,占30.77%)突变多见。检出3株(5.56%)XDR-TB菌株和10株(18.52%)Pre-XDR-TB菌株。结论:温州市MDR/RR-TB患者以本地、中老年、无固定职业、男性为主,复治比例较高。菌株对一线抗结核药物、氟喹诺酮类药物、丙硫异烟胺的耐药率较高,以kat G、rpo B、emb B、rps L、pnc A、gyr A基因突变为主,对贝达喹啉、利奈唑胺、环丝氨酸、氯法齐明等耐药率较低。MDR/RR-TB中Pre-XDR-TB比例较高。