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lprG基因表达上调对THP1细胞表达谱的影响

     

摘要

目的 分析lprG基因表达上调对THP1细胞表达谱的影响.方法 建立稳定表达lprG的THP1细胞系,通过qPCR及Western印迹法检测lprG的表达.用RNA-seq分析稳定表达1prG对THP1细胞基因表达谱有何影响.对测序数据进行分析,作GO及KEGG通路的显著性富集分析,并选取6个差异表达基因进行qPCR验证.结果 成功构建稳定表达lprG的THP1细胞系.RNA-seq检测发现共有712个差异表达的基因,其中419个上调,占58.8%,293个下调,占41.2%.富集分析显示,lprG的异位表达可影响THP1细胞多种生理或代谢过程.qPCR结果与RNA-seq结果一致.结论 lprG会影响THP1细胞内与Toll样受体信号通路、补体、细胞吞噬、溶酶体及过氧化物酶体等过程相关的基因的表达,这可为进一步研究lprG与巨噬细胞相互作用机制提供前期基础.

著录项

  • 来源
    《同济大学学报(医学版)》|2018年第4期|11-16|共6页
  • 作者单位

    同济大学附属上海市肺科医院检验科,上海200433;

    同济大学附属上海市肺科医院检验科,上海200433;

    同济大学附属上海市肺科医院检验科,上海200433;

    同济大学附属上海市肺科医院检验科,上海200433;

    同济大学附属上海市肺科医院检验科,上海200433;

    同济大学附属上海市肺科医院检验科,上海200433;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 R310.41;
  • 关键词

    lprG基因; THP1细胞; 转录组测序;

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