衣原体噬菌体衣壳蛋白Vp1及其高保守区二级结构及B细胞表位研究

摘要

目的:分析衣原体噬菌体Vp1蛋白及其高保守区的二级结构并预测其B细胞表位.方法:以ClustalX程序比对各株衣原体噬菌体衣壳蛋白Vp1序列获得高保守区序列.以Vp1氨基酸序列为基础,采用Gamier-Robson法、Chou-Fasman法、Eisenberg 法和Karplus-Schulz法分析蛋白二级结构;按Kyte-Doolittle法、Emini法和Jameson-Wolf法预测蛋白的抗原表位.结果:衣原体噬菌体Vp1蛋白的二级结构以β折叠为主,有少量α螺旋;其高保守区含多个抗原位点,预测其N端1-8,103-110,158-164,189-196,322-332,427-434,478-488为优势表位.结论:衣原体噬菌体Vp1蛋白及其高保守区存在复杂的蛋白结构,可形成多个可选表位.