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山羊痘病毒P32基因的克隆测序及序列分析

         

摘要

参考Genbank中的序列设计1对特异性引物对1株疫苗株和6株广西分离株的P32基因进行全基因序列测定和分析。结果显示,广西分离株间的核苷酸同源性为99.4%~100.0%,与疫苗株间的同源性为99.6%~99.9%,与Genbank中已发表山羊痘序列间的同源性为99.3%~99.8%;推导的氨基酸同源性为98.1%~100.0%、98.8%~99.7%、97.8%~99.4%;与国内疫苗毒株相比,广西分离株在100~105位缺失了6个碱基A,在651位所有广西分离株核苷酸的碱基全部由T变为C,647~652位核苷酸构成由TGTATA变异为TGTACA,多了1个限制性内切酶Bsp1407 I位点。研究结果为深入了解广西山羊痘分离株的分子特性以及山羊痘的诊断与防治奠定了基础。

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