新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因进化和变异分析

摘要

目的:对新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因的进化和变异进行分析,为进一步研究致病性禽流感的致病机制和毒力因子奠定基础.方法:从IRD数据库中下载2013年2月19日至2013年10月31日的H7 N9流感病毒PB1基因序列63条,运用MEGA 5.2.1软件进行序列分析,用邻接法构建基因进化树;通过氨基酸序列分析PB1基因95 ～367片段的PB1-F2蛋白氨基酸位点变化;应用Excel表格对氨基酸构成进行计算;运用Predictive Analytics Software (PASW) 18.0软件对氨基酸构成改变进行统计分析.结果:63株甲型H7N9毒株中有17株毒株的PB1-F2蛋白在其氨基酸序列第25位后发生断裂.新型甲型H7N9的进化主要分为两个系别,系别Ⅰ主要由完整型PB1-F2蛋白毒株构成,系别Ⅱ主要由52aa截短型PB1-F2蛋白毒株构成.完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白各类氨基酸构成存在差异.结论:H7 N9流感毒株中存在着截短型PB1-F2蛋白毒株,并且H7N9流感病毒毒株PB1-F2蛋白断裂位点均在25位氨基酸后,这将成为H7N9流感毒株进化过程中重要的特征.完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白氨基酸构成的差异对于甲型H7N9流感病毒致病性的影响有待进一步研究.