加权基因共表达网络分析筛选胰腺癌肿瘤免疫相关基因

摘要

分析胰腺癌免疫浸润,以期寻找胰腺癌免疫治疗的潜在靶点.利用加权基因共同表达网络分析方法和CIBERSORT算法分析TCGA数据库中胰腺癌的基因表达数据,识别与B细胞免疫浸润水平相关的基因模块.通过共表达网络和PPI交互网络分析,确定了9个枢纽基因CD79B、MYC、BANK1、TIMELESS、CD19、ATF3、ITGAL、IKZF3和RRAGB.通过TIMER、Kaplan-Meier和差异表达基因等分析,结果显示ITGAL在B细胞中高表达,在胰腺癌组织中显著上调,且该基因在胰腺癌中高表达与预后良好显著相关.