盐胁迫下拟南芥去乙酰化酶基因的转录组分析

摘要

为了探究盐胁迫下拟南芥HD2去乙酰化酶调控的下游基因,本研究以拟南芥野生型WT和四突(hd2q,HD2四个基因的突变体)为材料,采用RNA-seq技术和生物信息学方法,对生长10 d的幼苗在高盐(150 mmol/L NaCl)处理前和后进行比较转录组分析,并结合实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性.结果显示:在高盐处理前WT和hd2q共有25个差异基因,其中上调基因2个,下调基因23个.在高盐处理后,WT和hd2q共有1407个差异基因,其中上调基因772个,下调基因635个.GO和KEGG分析显示,对照组的差异基因主要富集在胞外区域和响应脱落酸上,盐处理组的差异基因主要富集在胞外区域和细胞壁上,并且发现有41个与盐响应途径相关的差异基因(27个上调基因,14个下调基因).结果表明拟南芥HD2去乙酰化酶调控下游盐响应基因从而使拟南芥适应盐胁迫环境.