2株不同来源的新城疫病毒的F基因克隆和序列分析

摘要

以1株从发病鸽中分离到的新城疫病毒(PNDV/99株)和1株从发病鹅中分离到的新城疫病毒(GNDV/00株)为研究对象,用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)对它们的F基因进行分段扩增、定向克隆到pUC119质粒载体,然后测定它们的核苷酸序列,并推导出相应的氨基酸序列。PNDV/99株和GNDV/00株的F基因全长1662bp,编码553个氨基酸,它们的裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,是NDV弱毒株特有的序列结构。序列分析结果表明,它们2株之间的核苷酸同源率高达99.28%,氨基酸同源率则为100%;它们与国内标准毒株F48E9的核苷酸同源率只有87.48%和87.36%,氨基酸的同源率都为91.68%;而它们与弱毒株LaSota的核苷酸同源率则为98.50%和98.74%,氨基酸同源率都为98.73%。