犬瘟热病毒水貂分离株H基因的遗传多样性分析

摘要

以犬瘟热病毒水貂分离株的RNA为模板,对分离株的H基因进行RT-PCR扩增,扩增产物纯化后与pMD-18T SimpleVector连接,成功地构建了克隆质粒pMD-18T-CDVH。序列分析表明,分离株H基因由1596 bp组成,编码532个氨基酸,含有5个潜在的N-联糖基化位点,12个半胱氨酸残基。与已发表的24株CDV毒株进行同源性比较,核苷酸序列同源性在90.7%～98.6%之间;推导的氨基酸序列同源性在89.9%～97.0%之间。与Onderstepoort、Convac、Hamatsu、A75/17、TN株相比,根据推导的氨基酸序列比较分析表明,N-联糖基化位点的数目与位置均存在差别。聚类分析结果表明分离株与Snyder Hill毒株的亲缘关系最近,二者与疫苗株Onderstepoort和Convac具有较高的同源性,组成一组,而与标准野毒强毒株Hamatsu的亲缘关系较远。