基于Illumina测序分析青海土族牙周病患者可疑致病微生物的组成差异和种群结构

摘要

目的 初步探究青海土族人群中牙周病可疑致病微生物的组成差异和种群结构.方法 选择青海省土族居民牙周病样本10例,利用Illumina MiSeq平台进行细菌16S rRNA基因(V3-V4区)高通量测序,并利用Mothur软件分析微生物的群落结构和多样性.结果 基于97％的相似性类聚,获得牙周病组物种注释OTU(Operational taxonomic unit)数目为156个,分类地位明确的细菌属有48个.土族牙周病患者中检出的已知致病微生物种属主要包括消化链球茵属Peptostreptococcus、微单胞茵属Parvimonas、卟啉单胞茵属Porphyromonas、普雷沃茵属Prevotella、拟杆菌属Bacteroides、密螺旋体属Treponema和小类杆菌属Dialister,以及可疑的致病微生物属肠杆菌科未知属Enterobacteriaceae unclassified、希瓦氏茵属Shewanella、克雷伯氏茵Klebsiella、奈瑟氏茵属Neisseria、嗜血杆菌属Haemophilus、乳球菌属Lactococcus、明串珠菌属Leuconostoc、韦荣球菌属Veillonella、普罗维登斯茵属Providencia等.结论 青海土族人群中牙周病可疑致病微生物的组成差异较大、种群结构复杂.