肝选择性未知基因loc91614的功能预测及表达研究

摘要

目的:预测肝脏组织选择性未知基因loc91614的功能,实验验证其基因表达.方法:构建含未知基因的肝组织选择性细胞通讯(LSCC)基因网络,再进行聚类、文献挖掘、基因本体、KEGG通路、Transfac转录因子结合位点等分析,用以预测loc91614的功能特征,最后,从mRNA和蛋白质水平验证其基因表达.结果:获得21个节点的LSCC基因网络,聚类显示loc91614与apob密切关联；文献挖掘显示基因与肝组织、胞质、脂等关键词显著相关；GO功能富集分析揭示loc91614具有细胞通讯、信号转导、细胞内信号级联的功能,有7个TFBS可对含loc91614的靶基因集进行调控,loc91614基因在肝细胞表达明显高于肝癌细胞.结论:loc91614可能分布于肝细胞的胞质中,很可能在肝组织中发挥细胞通讯等功能,也可能参与肝脏的糖、脂代谢过程,在肝细胞选择性高表达.