一种侵染薇甘菊的中国胜红蓟黄脉病毒DNA-A基因组特征及重组分析

摘要

为明确采集自我国广西壮族自治区玉林市博白县的疑似为双生病毒侵染并表现叶片黄脉症状薇甘菊的病原物及其基因组分子特征,利用双生病毒DNA-A通用引物SPG1/SPG2和特异性引物WGJ-F/WGJ-R扩增获得病毒基因组,利用β卫星通用引物检测卫星病毒,使用Vector NTI Advance 11.5.1软件进行序列拼接,运用MEGA 7.0和RDP 3.44软件进行系统发育树的构建和重组分析。结果表明:引起薇甘菊叶片黄脉症状的病原物为中国胜红蓟黄脉病毒(Ageratum yellow vein China virus,AYVCNV),该分离物命名为AYVCNVWGJ,GenBank登录号为MK880139,但未扩增得到β卫星。该病毒DNA-A基因组全长为2 755 bp,含有6个开放阅读框。AYVCNV-WGJ分离物与AYVCNV鳢肠Eclipta prostrata分离物(GenBank登录号MN218667)的核苷酸序列同源性最高,为90.1%,其中AC4编码的蛋白变异较大。重组结果分析显示AYVCNVWGJ分离物是由AYVCNV-Tomato分离物(GenBank登录号KU954388)和1个未知病毒(GenBank登录号EU487047)重组得到,重组区域为其基因组2 046~2 612 bp区域。