小鼠凋亡相关新基因TFAR19 cDNA的克隆化和序列分析

摘要

目的：了解一个细胞凋亡相关新基因ＴＦＡＲ１９在不同种属间的序列同源性。方法：利用表达序列标签（ｅｘｐｒｅｓｅｄｓｅｑｕｅｎｃｅｔａｇ，ＥＳＴ）拼接技术、ＲＴＰＣＲ、ＤＮＡ序列测定技术及计算机分析技术。结果：首次成功进行了小鼠ＴＦＡＲ１９ｃＤＮＡ编码区的ｃＤＮＡ克隆化和序列分析，发现小鼠和人ＴＦＡＲ１９在核苷酸水平上有８１．４％的同源性，在氨基酸水平上有高达９６％的同源性。功能区分析发现，小鼠ＴＦＡＲ１９ｃＤＮＡ序列含编码１２６个氨基酸的开放性读码框架，含１个可能的ｃＡＭＰ和ｃＧＭＰ依赖的蛋白激酶磷酸化位点，４个可能的ＰＫＣ磷酸化位点。其Ｃ端的“ＥＤＤＡＤＹ”序列与人ＤＮＡ拓扑异构酶Ｉ１４１１４７位残基序列完全相同。结论：小鼠ＴＦＡＲ１９是与人ＴＦＡＲ１９高度同源的新基因，与ＤＮＡ拓扑异构酶Ｉ可能有功能相关性。