灰斑古毒蛾核型多角体病毒EcoRⅠ-U片段的克隆与序列分析

摘要

【目的】分析灰斑古毒蛾核型多角体病毒（Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus，OrerNPV）EcoRⅠ-U片段分子生物学特征，为研究其分子特性及其在OrerNPV感染周期中的功能提供科学依据。【方法】克隆、分析OrerNPV EcoRⅠ-U片段所包含的若干基因，并应用生物软件对OrerNPV泛素基因（Ubi基因）进行了进化分析。【结果】OrerNPV EcoRⅠ-U片段包含Ubi基因、AcORF34同源基因和39K基因部分序列，在该区域中编码Ubi基因的开放阅读框（ORF）由246个核苷酸组成，可以编码81个氨基酸，预汁蛋白质分子质量为8．9ku。OrerNPV Ubi基因与苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒（AcMNPV）、家蚕核型多角体病毒（BmNPV）、薄荷灰夜蛾核型多角体病毒（RaouM-NPV）的同源性最高，均达92％，与小菜蛾颗粒体病毒（Plutella xylostella granulovirus，PxGV）的同源性最低，为62％。OrerNPV与AcMNPV、BmNPV和RaouMNPV的亲源关系最近。EcoR Ⅰ-U片段＋M13端含有编码39K基因（pp31）的部分序列，该多肽与10种NPV的39K序列有48％～52％的同源性。【结论】明确了OrerNPV EcoRⅠ-U片段的序列特征及OrerNPV Ubi在泛素蛋白家族中的进化关系。