苹果微型反向重复转座元件(MITE)的分离与鉴定

摘要

[目的]从苹果基因组中分离微型反向重复转座元件(MITE),研究其对苹果基因组进化的作用.[方法]利用PIF转座酶简并引物扩增苹果PIF转座酶基因,采用染色体步移技术获得PIF转座酶基因的未知侧翼序列,使用EMBOSS的Eiverted软件查找靶位点重复(target site duplication,TSD)和末端反向重复(terminal inverted repeat,TIR)序列.[结果]苹果MITEs拥有MITEs的典型特征,包括长度短,不具有潜在的编码能力,富含A+T,易插入非编码区,有TIRs和TSDs,有形成二级结构的可能.[结论]苹果MITEs属于Tourist家族,与苹果PIFDNA转座子相关;苹果MITEs与基因相连,在基因调节上起重要作用;苹果MITEs具有潜在的转座能力,对苹果遗传多样性、进化及育种有重要作用.