漆树WRKY转录因子基因家族生物信息学分析

摘要

漆树作为中国古老的经济树种,具有巨大的经济价值。WRKY转录因子是植物抗逆过程中最为常见的蛋白家族。为探索WRKY转录因子在漆树生长发育及抗逆境胁迫中的作用,以漆树转录组测序结果为试验材料,通过对保守结构域分析和多序列比对,共筛选出20个具有WRKY保守域的基因,根据WRKY结构特征,将筛选出的基因分为3组,其中Ⅱ组根据保守基序分析又可分为5个亚组。通过构建漆树和拟南芥WRKY基因家族系统进化树,分析漆树WRKY基因同源性,并根据其与拟南芥同源漆树基因进行功能预测。同时,对漆树WRKY转录因子在漆树不同部位的差异表达做分析,TvWRKY2、TvWRKY11、TvWRKY14、TvWRKY16、TvWRKY17、TvWRKY19、TvWRKY8、TvWRKY15在根中表达水平上调。通过对漆树WRKY转录因子基因家族进行系统的生物信息学分析,为进一步分析特定WRKY基因功能提供了参考,同时为后续深入研究漆树WRKY蛋白的结构与功能奠定了理论基础。