干旱胁迫下大苞萱草WRKY基因家族成员鉴定及生物信息学分析

摘要

WRKY是植物中最大的转录因子家族之一,参与植物的生长发育以及响应生物和非生物胁迫,在植物对干旱胁迫反应的调控网络中发挥着重要作用。对干旱胁迫下大苞萱草在根和叶中的转录组进行测序并分析数据,鉴定大苞萱草WRKY(HmWRKY)基因家族成员并分析其理化性质、蛋白质二级结构、保守基序以及组织表达特性。结果表明,共鉴定出HmWRKY基因家族成员41个,其中包括Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类,Ⅱ类可分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd、Ⅱe亚类。HmWRKY基因家族成员的氨基酸数量为92~641,理论等电点为4.97~9.99,总平均亲水性均为负值,因此HmWRKY蛋白均为亲水性蛋白。通过对HmWRKY基因表达量分析发现,干旱胁迫下叶中共有10个上调基因,29个下调基因,根中共有20个上调基因,21个下调基因。根据差异基因的表达分析,HmWRKY9基因可能参与大苞萱草的抗旱性调控,确定为候选基因,为进一步研究其功能提供参考。