利用Monte-Carlo模拟评价基因水平的关联分析方法

摘要

采用Monte-Carlo模拟了多种参数条件下的遗传关联数据,计算多种基因水平的关联分析方法的统计效能.结果显示:主成分Logistic回归分析(累积贡献率为95%)和我们之前发展的基于LD结构和Fisher组合法的新方法(LD-Fisher)在多种参数条件下都具有很高的统计效能,Fisher组合法只有在单个易感SNP的P值较小时或者存在多个P值不太小的易感SNP时表现较好.主成分Logistic回归分析和LD-Fisher可以作为基因水平关联分析的较为理想的分析方法.