橙色红曲菌Rab蛋白家族的生物信息学分析

摘要

Rab蛋白调控蛋白在细胞中的运输,发现其与丝状真菌的生长发育、液泡融合、自噬及次级代谢产物的合成有关。为鉴定及分析橙色红曲菌(Monascus aurantiacus)AS3.4384中的Rab蛋白家族种类及功能,本论文以酵母菌Rab家族的蛋白序列为同源序列,利用Blast程序在橙色红曲菌蛋白序列中进行同源搜索,并利用生物学软件对所预测到的Rab蛋白进行性质预测、结构域分析、基因结构分析和系统进化分析。结果发现,AS3.4384中共有9个Rab蛋白,均为小分子量的亲水蛋白且均能定位于细胞器膜上。通过系统发育树及序列比对分析,发现此9个Rab蛋白在红曲菌中是相对保守的。本研究为具体深入研究Rab蛋白的功能提供理论依据,为减少红曲菌产生桔霉素提供新思路。