基于网络药理学和分子对接探讨灵芪胶囊治疗结直肠癌作用机制

摘要

目的通过网络药理学和分子对接探讨灵芪胶囊(LQC)治疗结直肠癌(CRC)的分子作用机制。方法从中药系统药理学数据库(TCMSP)获取LQC有效成分及靶蛋白数据,从OMIM、TTD、GeneCards数据库获取CRC相关靶点数据,比对得到交集靶点并用STRING数据库构建PPI网络,用Cytoscape软件构建LQC成分-靶点网络图。使用“NetworkAnalysis”插件分析网络拓扑参数并筛选核心基因,借助David6.8数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)、京都基因组百科(KEGG)富集分析,结合THPA数据库分析核心基因的蛋白表达情况,再利用分子对接分析LQC与核心靶点的亲和力。结果数据挖掘共获得LQC有效成分227种,对应382个潜在靶点。GO与KEGG功能富集分析结果主要涉及HIF-1、IL-17、肿瘤坏死因子等信号通路;TIMER数据库分析显示VEGFA、ESR1、SNAI1、PPARG、MMP9、PARP1、DNMT1、AR、IFNG、PGR、NFKB1表达在正常组织与CRC组织之间有显著差异,其中VEGFA、AKT1、PARP1在CRC组织中呈强阳性表达,分子对接验证发现谷甾醇和脱皮甾酮与核心靶点有较高的亲和力。结论LQC中的多种成分可能通过多靶点、多通路发挥抑制CRC的作用,其可能是一种有前景的CRC候选药物。