SQLE在乳腺癌中的表达及其临床意义的生物信息学分析

摘要

目的:利用生物信息学方法分析角鲨烯环氧化酶(squalene epoxidase,SQLE)在乳腺癌中的表达情况及其临床意义.方法:挖掘Oncomine和GEPIA数据库中SQLE在乳腺癌和正常乳腺组织中的表达情况,分析CCLE数据库中SQLE在乳腺癌细胞系中的表达水平,同时利用HPA和UALCAN数据库分析SQLE蛋白在正常和乳腺癌组织中的表达水平,并利用免疫组化方法通过临床样本进一步验证SQLE蛋白的表达情况.最后用K-M plotter数据库和GEPIA数据库分析SQLE表达与预后的关系.结果:Oncomine和GEPIA数据分析显示SQLE基因在乳腺癌组织中高表达,CCLE数据分析表明SQLE在乳腺癌细胞系中显著高表达,HPA数据库免疫组化结果和UALCAN数据库结果以及临床样本免疫组化结果均显示乳腺癌组织SQLE蛋白相对于正常乳腺组织高表达;Kapan-Meier Plotter和GEPIA数据库分析显示高表达SQLE的乳腺癌预后不良.结论:SQLE在乳腺癌组织和细胞中均高表达,其可能是乳腺癌中潜在的促癌基因,有望成为乳腺癌治疗的新靶标.