非小细胞肺癌甲醛固定石蜡包埋切片DNA再利用的可行性研究

摘要

目的对非小细胞肺癌(NSCLC)甲醛固定石蜡包埋(FFPE)标本经免疫组化染色后的DNA质量进行评估,旨在探讨针对标本量较少或难以获取的标本利用免疫组化染色后进行DNA提取及相关分子检测的可行性。方法随机选取2017年6月至2017年12月东部战区总医院病理科NSCLC FFPE标本50份,每份标本分别切片12张。随机选取其中6张切片作为对照组,直接进行DNA提取;其余6张切片作为实验组进行免疫组化Envision二步法染色后进行DNA提取。对所有提取DNA进行表皮生长因子受体(EGFR)、鼠类肉瘤病毒癌基因(KRAS)以及鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌基因同源体B1(BRAF)基因突变检测。结果 50份NSCLC FFPE标本实验组提取DNA浓度及纯度与对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。50份实验组NSCLC FFPE标本中,EGFR基因突变率为40%(20/50)、KRAS基因突变率为16%(8/50)、BRAF基因突变率为10%(5/50);50份对照组NSCLC FFPE标本中,33份分别检测出相应的EGFR、KRAS、BRAF基因突变,17份检测出阴性结果。实验组和对照组检测结果符合率达100%。结论 NSCLC FFPE标本,尤其是标本量较少或难以获取的样本,经免疫组化染色后能够提取高质量的DNA,且可用于靶基因的下游分子分析,为稀缺或难以获取的临床样本后续分子检测提供一种解决办法。