环介导等温扩增技术检测HIV-1 DNA

摘要

目的:建立环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法检测HIV-1 DNA。方法:首先从HIV-1数据库和基因库中下载不同亚型的HIV-1的LTR区序列,输入到MEGA 6.0软件中,用Cluster W程序进行比对与编辑,选择相对保守的区域并以FASTA格式输出。将FASTA格式文件上传至在线引物设计软件Lamp primer designing software primer explorer中,获得引物后再次与比对后的HIV序列进行比较,对保守性较差的位点使用简并碱基。用LAMP扩增试剂盒扩增时加入荧光目测试剂,观察反应管颜色变化,判断阴阳性结果。结果:本研究中设计的引物可用于LAMP技术检测HIV-1 DNA,具有较好的灵敏度和特异性。结论:成功地建立了LAMP技术检测HIV-1 DNA的方法,可用于HIV-1的早期诊断。