运用生物信息学方法鉴别易混种射干和鸢尾

摘要

利用Gen Bank核酸数据库中rbc L序列鉴定观赏药用植物易混品种射干和鸢尾。在Gen Bank核酸数据库下载射干和鸢尾的rbc L序列,NCBI虚拟PCR方法获取共有的对应片段,应用MEGA5.0软件计算种内种间（K2P）遗传距离和构建邻接（NJ）系统聚类树。获得4个射干rbc L序列及7个鸢尾rbc L序列,这些序列在30bp-630bp之间具有对应序列,基于该段序列分析显示射干和鸢尾之间的K2P遗传距离0.01,远大于鸢尾种内遗传距离（0.001）与射干种内遗传距离（0）;NJ系统聚类树结果表明能将射干和鸢尾区分开来,分别单独聚为一类。结果表明：所选rbc L序列适用于射干和鸢尾的鉴别,可为射干和鸢尾准确应用提供鉴定依据。