基于miRNA-mRNA调控关系对与Cox回归模型的宫颈鳞状细胞癌预后生物标志物综合分析

摘要

目的:探究微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)关系对在宫颈鳞状细胞癌(CESC)中的表达,分析其预测CESC预后的意义.方法:利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库筛选CESC和正常宫颈组织中miRNA和mRNA的差异表达谱,利用miRTarBase、TargetScan和miRDB数据库验证miRNA与靶向mRNA的相互作用关系,并通过Cytoscape软件可视化,采用Kaplan-Meier生存分析确定CESC的预后标志物,构建与CESC预后相关的miRNA-mRNA调控网络,并对筛选出的mRNA进行基因本体功能(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:通过比较CESC组织与正常宫颈组织,共检测到4个miRNA可纳入预后风险评分模型,生存分析筛选出9个与CESC预后相关的差异表达mRNA,最终得到与CESC预后紧密相关的4个miRNA-mRNA调控关系对,hsa-miR-505-5p的靶向mRNA为染色质结构域蛋白8(CBX8),hsa-miR-142-3p分别靶向Ⅰ型血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶3(ADAMTS3)、蛋白酪氨酸磷酸酶受体B(PTPRB)和SEC23同源物A(SEC23A).生物学功能和通路分析显示,差异表达的mRNA主要在生物学过程和磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、人乳头瘤病毒(HPV)感染的通路中显著富集.结论:miRNA-mRNA关系对与CESC预后相关,可作为今后CESC发病机制研究的新角度以及监测预后的有效指标.