mRNA序列固有特征与翻译延伸速率的统计相关性

摘要

统计了酿酒酵母基因组中mRNA密码子使用和茎环结构与翻译延伸速率的相关性。结果表明,所有稀有密码子都具有慢速解码的特点,富含GC比富含AU的密码子解码速度更慢。在密码子水平上,纯茎(环)结构对快慢翻译速率的偏好性不明显,而当一个密码子的前2位碱基处于茎结构中,以及第3位碱基处于环结构中时,这类杂合结构显著偏好慢翻译区,上述统计证据支持这样的观点,即mRNA的密码子使用和茎环结构是调节翻译延伸速率的关键因素。