大肠杆菌编码序列碱基片段的统计分析

摘要

对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之内 ;编码区出现最多的碱基片段是多聚A ;编码开始区域和编码终止区域的碱基构成模式有明显区别 ;编码开始区域里GGA类的稀有片段恰恰是SD区域最偏好的碱基片段 ;密码子之间 ,以TAG或CTA构造的关联模式为编码区禁用模式 .另外 ,还发现编码开始区域或编码终止区域碱基片段的相对频率与基因表达水平有明显关系 ,多数高频出现的碱基片段其相对频率随基因表达水平的提高而增加 .