红花檵木两个查尔酮合成酶的克隆及生物信息学分析

摘要

为了研究红花檵木花青苷生物合成的分子机制,克隆了红花檵木两个查尔酮合成酶LcCHSs基因,并对克隆的两个基因进行了生物信息学分析.利用RT-PCR技术,克隆得到红花檵木LcCHS1和LcCHS2基因,其中LcCHS1的开放阅读框(ORF)为1170 bp,编码389个氨基酸,LcCHS2的ORF为1182 bp,编码393个氨基酸.两个LcCHSs的氨基酸序列与来源于茶树(Camellia sinensis)、葡萄(Vitis vinifera)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tabacum)等植物CHSs的氨基酸序列一致性超过83％,且两个LcCHSs的氨基酸序列中参与CHS酶类催化的3个残基(Cys164、His303和Asn336)和两段CHS酶类重要序列("RLMMYQQGCFAGGTVLR"和"GVLFGFGPGL")均严格保守,表明CHS在进化功能上的保守性.三级结构预测表明两个LcCHSs都能形成同源二聚体,且两个LcCHSs蛋白的空间结构非常相似.