SYBR Green荧光定量PCR法对BCL11B基因座位相互作用位点的验证分析

摘要

目的:研究在不同类型细胞核中,位于不同染色体上的BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用关系.方法:通过SYBR Green荧光实时定量PCR法,分别对MCF-7和Jurkat细胞的3C(染色体构象捕获)样品进行定量分析,分析分别位于不同染色体上的BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用频率.结果:与TaqMan探针法相比较,基于SYBR Green荧光实时定量PCR法对3C样品的分析同样具有良好的特异性.在MCF-7和Jurkat细胞中,BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用频率存在很大的差异.结论:SYBR Green荧光实时定量PCR法在染色体构象捕获技术中具有很好的特异性；BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用具有细胞类型特异性.