牙鲆微卫星标记的筛选及群体多态性分析

摘要

以牙鲆(Paralichthys olivaceus Temminck et Schegel)为材料,基因组DNA经Sau3A Ⅰ进行部分酶切后,选取400～1 200bp大小的片段连接到经BamHⅠ酶切的pUC19质粒中,连接产物转化大肠杆菌DH5α,构建牙鲆酶切片段基因组文库.采用菌落杂交的方法,以(AC)10、(AG)10为探针从文库中筛选阳性克隆16个,共得到20个微卫星序列,其中完全型13个,不完全型5个,复合型2个.对其中18个进行引物设计,有11对引物扩增出目的片段,其中8对引物在群体中具有扩增多态性.在威海野生牙鲆30个个体中,各座位上得到的等位基因数为4～19个,观测杂合度(Ho)为0.413 8～0.965 5.其中有3对引物扩增的等位基因数超过17个,表现出高度多态性.本研究旨为进一步的牙鲆遗传多样性分析、家系分析及遗传图谱的构建等提供基础依据.