基于网络药理学和分子对接探讨真武汤治疗慢性肾衰竭的作用机制

摘要

目的:利用网络药理学和分子对接方法探讨真武汤治疗慢性肾衰竭(CRF)的作用机制。方法:采用TCMSP数据库筛选真武汤中有效成分及靶点,并将靶点导入Uniprot数据库匹配基因名。利用OMIM、Drugbank、Genecards、CTD数据库筛选CRF靶点并与真武汤靶点取交集。将交集靶点导入STRING数据库进行PPI分析并找出核心靶点。通过DAVID数据库进行KEGG和GO分析,根据KEGG结果构建药物-靶点-通路-疾病网络,并将所有网络图导入Cytoscape软件进行可视性优化。从TCMSP数据库中下载有效成分结构文件,从RCSB PDB数据库下载靶点蛋白骨架,利用Python和AutoDock系列软件进行分子对接验证。结果:共筛选出交集靶点70个,并根据PPI网络和药物-靶点-通路网络综合分析,药物治疗疾病主要有效成分可能为山奈酚、β-谷甾醇、芍药苷等;核心靶点主要有AKT1、IL6、TNF、MAPK8、TGFB1、RELA等;主要涉及TNF、Toll样受体、NF-κB、HIF-1等信号通路;分子对接各成分与蛋白骨架结合状态良好。结论:真武汤通过山奈酚、β-谷甾醇、芍药苷等有效成分作用于AKT1、IL6、TNF、MAPK8、TGFB1、RELA等靶点治疗CRF,调控过程可能和TNF、Toll样受体、NF-κB、HIF-1等信号通路有关。