基于生物信息学分析γ-谷氨酰基环转移酶基因表达在胃癌中的意义

摘要

目的 γ-谷氨酰基环转移酶(GGCT)是一种参与谷胱甘肽代谢的酶,异常表达的GGCT与多种肿瘤的发生发展紧密相关,但GGCT在胃癌中的潜在生物作用仍有待进一步挖掘.方法 通过UALCAN和Oncomine数据库分析GGCT基因的转录水平,Kaplan-Meier plotter数据库分析GGCT基因表达与患者生存之间的关系、与不同临床病理特征胃癌患者预后的相关性,LinkedOmics数据库分析GGCT基因正负相关的网络基因,MetaScape数据库分析GGCT基因及网络基因功能注释及基因通路,最后结合TIMER数据库研究GGCT基因与免疫细胞浸润的相关性.结果 胃癌组织中GGCT mRNA水平及DNA拷贝数高于相应的正常组织(P<0.05).GGCT高表达组的总生存期、首次进展期及进展期明显长于低表达组(P<0.05).高表达GGCT延长了单纯手术治疗患者、HER2阴性和HER2阳性患者、低分化以及II/III/IV期胃癌患者总生存期(P<0.05).GGCT基因及相关网络基因参与了细胞周期、跨膜损伤运输、cGMP-PKG信号通路、肌肉收缩、Apelin信号通路和一氧化氮刺激鸟苷酸环化酶等过程.GGCT的表达与不同发育阶段的CD4+T、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞浸润水平有一定的相关性.结论 GGCT基因与胃癌患者的预后及免疫浸润有关,为进一步研究GGCT在胃癌中的作用奠定了基础.