鸡UCP3基因结构与功能的生物信息学分析

摘要

目的:对鸡解偶联蛋白(UCP3)基因的结构与功能进行生物信息学分析。方法:借助生物信息分析软件解析鸡UCP3基因序列及其蛋白的理化性质、结构域、信号肽、跨膜结构和亚细胞定位等特性,并比较多物种氨基酸序列的同源性和遗传进化程度。结果:鸡UCP3基因序列长度为924 bp,编码307个氨基酸,氨基酸组成中以缬氨酸、丙氨酸和亮氨酸占比较高,超10%。鸡UCP3蛋白分子式为C_(1478)H_(2384)N_(410)O_(422)S_(15),相对分子质量为33130.58,理论等电点为9.50,不稳定系数为41.02,脂肪指数97.82,为疏水蛋白。预测UCP3蛋白结构特点,发现UCP3蛋白的结构以-螺旋(47.23%)为主,具有3个线粒体载体结构域,有25个磷酸化位点和2个O型糖基化位点,亚细胞定位显示其主要分布在线粒体中;信号肽预测表明其属于非分泌蛋白。同源性比对结果表明,在选用的14个物种中,鸡UCP3基因氨基酸序列与火鸡的同源性最高,达99.02%,而与哺乳类动物和水生动物同源性较低。构建的系统进化树中主要分为3支,其中禽类、哺乳类为相对独立的两支,鱼类和两栖动物为第3支。在系统进化树中,与火鸡的遗传距离最近,与同源性分析结果一致。结论:该分析结果将为深入研究鸡UCP3基因的结构和生物学功能提供重要参考。