锦鲤疱疹病毒胸苷激酶基因的生物信息学分析

摘要

[目的]探究锦鲤疱疹病毒胸苷激酶(Thymidine Kinase,TK)基因编码蛋白的生物学特性及结构功能特征。[方法]采用生物信息学软件对胸苷激酶蛋白的理化性质、亲/疏水性、结构域及二级结构和三级结构进行预测分析。[结果]TK蛋白编码224个氨基酸,不稳定系数较大,属于不稳定蛋白;且该蛋白不含有信号肽及跨膜结构,位于膜外;结构域位于2-175氨基酸残基区域,与其他病毒氨基酸序列比对分析,锦鲤疱疹病毒TK基因与鲤科疱疹病毒亲缘关系较近。[结论]对锦鲤疱疹病毒TK基因的分析,为深入研究锦鲤疱疹病毒的特性及分子机制,采取更有效的精准防控措施提供了基础保障,也为下一步的研究计划提供了方向。