酉州乌羊LncRNA XLOC_15448的组织表达及其在黑色素沉积过程中互作分子的预测

摘要

长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)在哺乳动物的基因组中被广泛转录,能够通过相应的micRNA和靶基因发挥其生物学功能,并通过生物信息学预测和实验验证相结合方法,快速、有效地获取并筛选LncRNA靶基因.为探究酉州乌羊(Capra hircus)LncRNA XLOC_15448的组织表达谱及其在黑色素沉积过程的靶基因,本研究以酉州乌羊和酉州本地白山羊为实验对象,检测LncRNA XLOC_15448在各组织中的表达,比较其在乌皮与非乌皮中的表达差异;同时,检测LncRNA XLOC_15448在小鼠(Mus musculus)皮肤黑色素瘤细胞细胞系B16-F10中的表达特性;最后,通过靶micRNA和靶基因预测,构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络关系.研究结果显示,LncRNA XLOC_15448在酉州乌羊不同体组织中广泛表达,其中在心脏中的表达量最高,其次为肌肉、大脑、皮肤、肝、肾、肺、脾脏组织;其中在酉州乌羊皮肤中的表达量显著高于酉州本地白山羊皮肤组织;体外实验研究发现,随着B16-F10细胞的增殖,LncRNA XLOC_15448表达量呈递增趋势;同时,软件预测显示,LncRNA XLOC_15448可能通过靶向miR-182-5p调控小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)基因的表达.基于此,本研究表明LncRNA XLOC_15448可能通过LncRNA-miRNA-mRNA网络参与了酉州乌羊皮肤黑色素细胞的生长及黑色素的沉积,这为进一步深入探究山羊皮肤着色相关的lncRNA调控理论的研究提供了基础资料.