鸡ApoB基因g.-112A＞G单核苷酸多态性的功能性鉴定与分析

摘要

载脂蛋白B (apolipoprotein B,ApoB)在极低密度脂蛋白(very low density lipoproteins,VLDL)组装、转运以及脂类代谢中都具有重要作用.本课题组前期研究发现鸡(Gallus galls) ApoB基因g.-112A＞G单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与鸡腹脂重和腹脂率显著相关.生物信息学分析显示,该SNP位于鸡ApoB基因的启动子区,可能是功能性SNP.为确定该SNP的功能性,本研究开展了该位点不同基因型与血清生化指标的相关分析;比较了ApoB基因3种基因型在鸡肝脏和小肠中的表达水平;构建了含该SNP位点A和G等位基因的启动子报告基因载体,并利用双荧光素酶报告系统分析候选转录因子TATA-box binding protein (TBP)和CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBPα)对该SNP位点不同等位基因荧光素酶活性的影响.关联分析结果显示,携带GG基因型的公鸡高密度脂蛋白(highdensity lipoprotein,HDL)/低密度脂蛋白(low-density lipoprotein,LDL)显著高于AA型个体(P＜0.05);qRTPCR结果显示,在鸡肝脏和小肠组织,AG基因型的ApoB基因表达量显著低于AA和GG基因型(P＜0.05);报告基因检测结果显示,A等位基因荧光素酶活性显著高于G等位基因(P＜0.05).此外,转录因子TBP和C/EBPα对A等位基因荧光素酶活性的促进作用强于G等位基因(P＜0.05).上述结果提示,ApoB基因g.-112A＞G可能是功能性SNP位点,可初步确定其为优质鸡育种的功能性分子标记.本研究为深入探讨ApoB基因在脂肪生长发育中的功能提供了实验数据.