快速获得葫芦科核糖体失活蛋白新基因

摘要

根据葫芦科核糖体失活蛋白(ribosome-inactivatingprotein,RIP)上、下游两段高度保守的氨基酸序列设计简并引物对LY1/LY2,对基因组DNA进行PCR扩增,快速获得了3种RIP新基因,分别是冬瓜(Benincasa hispida)来源的benincasin(AF453777)、南瓜(Cucurbita moschata)来源的moschatinI(AF462349)和moschatinⅡ(AF504011).它们的编码区与葫芦科6个代表RIP对应区段的同源性分别为:trichosanthin(61%、69%和55%)、α-momorcharin(63%、72%和69%)、α-luffin(72%、83%和72%)、RIPfrom Cucumisfigarei(80%、69%和79%)、sechiumin(43%、43%和44%)以及bryodin1(62%、65%和58%).葫芦科RIP的LY1/LY2区段存在43个完全一样的氨基酸残基,其中8个残基在其它科属来源的8个Ⅰ型和3个Ⅱ型RIP中也完全保守,包括构成活性中心的4个关键残基.