盐城市2018—2019年手足口病和疱疹性咽峡炎病原学特征分析

摘要

目的 探讨盐城市近年手足口病(hand foot and mouth disease, HFMD)和疱疹性咽峡炎病原学特征,以及柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)、10型(CVA10)分离株VP1区序列分子进化规律。方法 收集全市哨点监测医院诊断为HFMD和疱疹性咽峡炎病例标本,采用实时荧光RT-PCR进行肠道病毒核酸检测,选取鉴定为CVA4和CVA10阳性标本开展VP1区序列测序,应用生物信息学软件构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸同源性和氨基酸变异位点。结果 2018—2019年,盐城市累计采集和检测1 289份病例标本,总体病毒核酸阳性检出率59.2%,HFMD和疱疹性咽峡炎阳性检出率分别为59.7%和57.1%,差异无统计学意义(χ^(2)=0.48,P=0.51);CVA6阳性检出率为31.3%,为优势血清型,EV71型、CVA16型、CVA6型、CVA10型、CVA4型样本阳性检出率差异均有统计学意义(P值均<0.05)。共分离12株CVA4型和31株CVA10型毒株,基因型均为F型和C型;分离毒株间核苷酸同源性分别为99.3%~100.0%和96.0%~100.0%,氨基酸同源性分别为91.3%~100.0%和99.3%~100.0%,亲缘关系较近;分别存在2个和4个氨基酸易变异位点。结论 盐城市2018—2019年HFMD和疱疹性咽峡炎病原体主要为CVA6型肠道病毒;CVA4和CVA10分离株流行基因型分别为F型和C型。