海蓬子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析

摘要

从盐生植物海蓬子的抑制消减杂交文库中克隆了DnaJ-like基因的长609 bp的DNA序列,编码1个202aa的开放阅读框,Northern Bloting显示该基因在检测子(200 mmol/L NaCl)中的表达显著增强.生物信息学分析表明,在蛋白质水平上,该片段与拟南芥和水稻的同源性分别为6e-68和1e-58;在核酸水平上,该片段与拟南芥的同源性为3e-24.保守区分析显示,该片段含有DnaJ-like基因完整的J功能域(J-Domain, 66aa),功能域在蛋白质水平与GenBank两种相关类型的J功能域的同源性分别为1e-11和9e-15.这为该基因的克隆及研究其在植物逆境胁迫中的作用奠定了基础.