AMHR2新型转录本AMHR2-SV1的鉴定及其在大鼠组织中的表达

摘要

本研究旨在鉴定抗苗勒氏管激素受体2(AMHR2)一种新的转录本,确定其在大鼠组织中的表达情况.采用TRIzol法提取组织总RNA;运用RT-PCR和克隆测序技术分析AMHR2基因的可变剪接体及其在大鼠各组织器官中的表达差异,同时利用NCBI ORF Finder识别剪接体序列阅读框,运用ExPASy-ProtParam和Conserved domains软件分别预测剪接体氨基酸构成及其性质和剪接体保守序列.AMHR2-SV1是AMHR2的一种新型转录本,命名为AMHR2-splice variant(AMHR2-SV1),与AMHR2参考序列比较,缺失第10外显子137 bp.利用NCBI ORF Finder和ExPASy-ProtParam,预测AMHR2-SV1编码429个氨基酸残基,其编码的蛋白质分子量为45 990.7.Conserved domains在线软件分析表明:AMHR2-SV1蛋白序列比完整AMHR2蛋白序列缺少128个氨基酸,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域不完整.检测结果表明,大鼠组织中均存在AMHR2和AMHR2-SV1两个转录本.在肝、脾、肺、肾、肾上腺和子宫组织中AMHR2表达量均高于AMHR2-SV1,差异达到显著水平;两种转录本在不同组织中表达趋势相同,卵巢中表达量最高,心脏中次之,其他组织表达量均显著低于卵巢和心脏.