希金斯炭疽菌中NPFxD基序蛋白找寻及其生物信息学分析

摘要

希金斯炭疽菌是一种半活体营养型植物炭疽病原真菌,能够侵染多种十字花科植物引起的炭疽病,特别是引起蔬菜炭疽病的重要病原。胞吞在真菌侵染植物过程中发挥着重要作用,该作用一般同具有NPFxD基序的蛋白受体介导有关,然而,目前有关该炭疽菌中胞吞作用相关蛋白尚未明确。基于前人已报道的构巢曲霉中NPFxD蛋白序列,通过关键词搜索以及Blastp比对等方法对希金斯炭疽菌蛋白质数据库进行NPFxD蛋白找寻,明确该菌中存在2个NPFxD蛋白序列,根据蛋白同源性,分别命名为ChMYO1、ChGBP2。同时,对这2个蛋白序列开展了保守结构域及跨膜区结构、蛋白质理化性、信号肽、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析。结果表明,ChMYO1、ChGBP2蛋白亚细胞定位情况不同,前者定位在质膜,后者定位在核内;两者在亲疏水性、最高氨基酸残基和其位置等均有着一定差异;两者均无明显的信号肽序列;两者均含有无规则卷曲、α螺旋、β卷曲,而缺乏TM螺旋。此外,对多个不同真菌中NPFxD基序同源蛋白序列开展遗传关系分析,明确希金斯炭疽菌中的NPFxD基序蛋白与炭疽菌属中其他病菌中的蛋白具有较高的同源性,本研究为进一步研究炭疽菌属NPFxD基序蛋白的功能提供了理论参考。