胡萝卜1个新4CL基因的克隆、进化及表达分析

摘要

胡萝卜(Daucus carota L.)在NCBI(美国国家生物信息中心)上总共公布了13个4-香豆酰-CoA连接酶(4 CL)基因,而在芹菜转录数据中发现1个4 CL基因,利用该基因序列设计1对克隆引物,成功得到1个新胡萝卜4 CL基因,命名为Dc4CL-1.Dc4CL-1基因长1635 bp,编码544个氨基酸,位于胡萝卜基因组第2染色体上.进化树分析显示,Dc4CL-1基因聚集在与木质素合成有关的4CLⅠ亚族.实时荧光定量PCR转录表达发现,在胡萝卜根生长发育期间,Dc4 CL-1基因在野生胡萝卜中高表达,而在栽培胡萝卜中低表达.推测Dc4 CL-1基因与胡萝卜木质素合成有关.