人巨细胞病毒UL142基因在临床低传代分离株中的多态性

摘要

目的研究人巨细胞病毒(HCMV)UL142基因在低传代分离株中的多态性,探讨其多态性与HCMV先天性感染不同致病性之间的关系.方法 27株经荧光定量PCR方法检测HCMV DNA阳性的低传代分离株进行UL142全序列PCR扩增,阳性13株PCR产物进行UL142基因测序及结果分析.结果 27株分离株UL142 PCR扩增,13株阳性,阳性率48.2%,以Toledo株为参考株序列比较表明,13株UL142可读框长度均与Toledo株相同,为921 bp,编码307个氨基酸的蛋白.DNA序列变异均为核苷酸替换,不同临床分离株UL142基因与Toledo株进行同源性比较,结果在核苷酸水平为94.4%～95.9%,氨基酸水平为89.9%～99.6%.二级结构预测分为三种构象.大多数HCMV UL142蛋白重要功能基团位点在所有分离株中均高度保守,仅四个位点在一些分离株中存在缺失或新增.系统进化树分析:除Toledo株外,13株核苷酸及氨基酸序列可分为3个基因组.结论 13株临床低传代分离株HCMV UL142基因DNA及其编码产物的氨基酸序列比较保守,但仍存在一定多态性.未发现不同临床分离株UL142基因多态性与HCMV先天性感染不同疾病表现的关系.