细粒棘球蚴14-3-3蛋白序列、结构及抗原表位的分析

摘要

目的应用生物信息软件分析细粒棘球蚴14-3-3（Eg14-3-3）蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构并预测B细胞表位和T细胞表位,为后续确定和筛选优势抗原表位、研制安全高效的多肽疫苗及特异性诊断抗原奠定基础。方法采用DNAstar软件、ProPred MHC Class-ⅡBinding Peptide Prediction Server和Biosun等软件对Eg14-3-3的序列、结构及B细胞表位和T细胞表位进行预测。结果Eg14-3-3为相对分子质量27 940、含有247个氨基酸的酸性蛋白质,其二级结构主要由有6个α-helix结构中间连接短β-折叠及不规则卷曲结构,序列具有高度多变性,预测该蛋白存在14个B细胞表位区域和6个T细胞表位。结论分析了蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构,并预测出Eg14-3-3存在14个B细胞表位和6个T细胞表位。