哈尔滨市HIV-1感染者TRIM5α基因多态性与艾滋病的相关性

摘要

目的分析编码TRIM5α蛋白的基因2号外显子单核苷酸基因多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）与艾滋病的相关性,并探讨病毒亚型对此相关性的影响。方法从331例已确诊但未接受治疗的HIV-1感染者的外周血单个核细胞（peripheral blood mononuclear cell,PBMC）中提取基因组DNA,扩增HIV-1病毒的Gag基因和编码TRIM5α蛋白基因的2号外显子基因并获得基因序列信息,统计单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）和构建Gag基因系统进化树图。以CD4+T淋巴细胞数200个/μL为界值将HIV-1感染者分为快速进展组（CD4＜200）和慢速进展组（CD4≥200）,并分析比较所有331例样本和各HIV-1亚型中TRIM5α基因多态性与艾滋病的相关性。结果在全部扩增的331条HIV-1的Gag基因中,有239条Gag基因序列与不同的CRF01AE亚簇聚集,CRF01AE亚型感染者占所有感染者的72.2%,其他亚型较少,故不进行相关性分析。我们共发现4个SNP位点（-2GC、127CT、334GT和407GA）,其中407GG基因型在所有样本和CRR01AE感染者的快速进展组和慢速进展组中都有明显的统计学差异（P＜0.05）,而407GA基因型只在CRF01AE感染者中有统计学差异。结论 突变位点-2G/C、127C/T、334G/T和HIV-1的感染无相关性,407G/A突变可能与宿主TRIM5α蛋白抗HIV-1的作用增强相关,而HIV-1病毒型别是研究TRIM5α基因多态性和艾滋病相关性应该考虑的因素。